琼脂糖是由1，3连结的β-D-半乳呋喃糖和1，4连结的3，6-脱水α-L-半乳呋喃糖相间联结而成。琼脂糖具有亲水性，并几乎完全不存在带电基团，极少吸附生物大分子也极少引起其变性，是理想的惰性载体。琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解，温度下降到35-40℃形成良好的半固体状的凝胶。琼脂糖凝胶是最常用的分离介质，用作电泳和层析载体，分离生物大分子（核酸、蛋白、多糖等）。